1、经费来源：民办专科由社会集团、集体、及个人投资，自负盈亏；公办专科由国家拨款辅助。

2、招生区别：民办专科在高考生进入高考期后，由本校派人直接到各地招收学员，个别民办专科也进入普通高考录取；公办专科由各当地教委抽取建档线以上，直接进入高等院校学习深造。

3、学费区别：民办专科一般收费高于公办专科。