《奇皇后》的结局是太后死了，廉屏秀被百姓们乱棍打死，脱脱战死，奇皇后已经成为了一代女王，元顺帝则退居幕后养病，两人一起回到了北方的大草原。

几年过后，奇皇后已经成为了一代女王，元顺帝则退居幕后养病，又过了几年，元国叛军开始进攻，奇皇后派出脱脱与元国叛军对战，脱脱一去不复返，最后奇皇后听到了脱脱战死的消息，当初脱脱奔赴战场之前，曾经叮嘱奇皇后做好撤退的准备，若平乱失败，就带着元顺帝退到蒙古草原。十几年的战争和天灾，叛军四起，随时有可能杀到京城，奇皇后来到元顺帝身边，却告诉妥欢说脱脱战胜了。随后又说想回到北方的大草原，元朝开始的地方。妥欢当即明白了战事失利，只是承娘在安慰自己。却也回答说都听承娘的。